Ligand validation:9VFC

LFA: EICOSANE

	Best-fitted instance in this entry
	Other instances in this entry

	Best-fitted instance in this entry
	Best-fitted PDB instances with different target (top 5)

Identifier	Ranking for goodness of fit	Ranking for geometry	Real space R factor	Real space correlation coefficient	RMSZ-bond-length	RMSZ-bond-angle	Outliers of bond length	Outliers of bond angle	Atomic clashes	Model completeness	Average occupancy
9VFC_LFA_C_503	33%	94%	0.105	0.914	0.26	0.18	-	-	0	50%	1
9VFC_LFA_G_408	31%	93%	0.117	0.926	0.25	0.23	-	-	0	50%	1
9VFC_LFA_D_411	29%	95%	0.119	0.918	0.26	0.17	-	-	1	50%	1
9VFC_LFA_D_416	29%	95%	0.151	0.854	0.25	0.18	-	-	1	100%	1
9VFC_LFA_B_505	27%	93%	0.134	0.912	0.25	0.21	-	-	1	60%	1
9VFC_LFA_A_508	26%	93%	0.117	0.884	0.26	0.22	-	-	0	55%	1
9VFC_LFA_G_412	25%	95%	0.128	0.924	0.27	0.14	-	-	0	45%	1
9VFC_LFA_A_510	24%	94%	0.148	0.871	0.25	0.19	-	-	3	80%	1
9VFC_LFA_A_514	24%	97%	0.123	0.934	0.28	0.09	-	-	1	35%	1
9VFC_LFA_F_505	23%	95%	0.131	0.918	0.28	0.15	-	-	0	45%	1
9VFC_LFA_E_505	23%	94%	0.154	0.919	0.25	0.2	-	-	1	60%	1
9VFC_LFA_G_414	23%	94%	0.163	0.898	0.25	0.2	-	-	1	75%	1
9VFC_LFA_C_505	23%	93%	0.139	0.916	0.25	0.22	-	-	0	50%	1
9VFC_LFA_E_513	21%	95%	0.148	0.91	0.25	0.18	-	-	0	55%	1
9VFC_LFA_B_508	21%	94%	0.149	0.852	0.25	0.2	-	-	1	80%	1
9VFC_LFA_G_403	21%	95%	0.131	0.904	0.27	0.15	-	-	1	45%	1
9VFC_LFA_B_503	20%	94%	0.137	0.861	0.25	0.19	-	-	0	65%	1
9VFC_LFA_D_412	20%	95%	0.142	0.903	0.26	0.16	-	-	0	50%	1
9VFC_LFA_B_517	19%	95%	0.143	0.877	0.26	0.16	-	-	0	60%	1
9VFC_LFA_B_514	17%	95%	0.157	0.905	0.26	0.16	-	-	0	50%	1
9VFC_LFA_D_401	17%	94%	0.146	0.862	0.26	0.18	-	-	0	60%	1
9VFC_LFA_B_511	17%	95%	0.133	0.898	0.27	0.16	-	-	2	35%	1
9VFC_LFA_E_502	16%	95%	0.134	0.887	0.28	0.13	-	-	0	40%	1
9VFC_LFA_G_411	16%	94%	0.156	0.853	0.25	0.2	-	-	1	70%	1
9VFC_LFA_B_506	16%	95%	0.154	0.896	0.28	0.13	-	-	0	50%	1
9VFC_LFA_B_516	16%	93%	0.189	0.872	0.23	0.25	-	-	0	85%	1
9VFC_LFA_E_519	16%	94%	0.177	0.816	0.24	0.21	-	-	1	100%	1
9VFC_LFA_B_504	16%	94%	0.15	0.863	0.26	0.19	-	-	0	60%	1
9VFC_LFA_B_509	16%	95%	0.139	0.878	0.28	0.15	-	-	1	45%	1
9VFC_LFA_A_517	15%	96%	0.139	0.888	0.28	0.12	-	-	1	40%	1
9VFC_LFA_G_413	15%	94%	0.155	0.867	0.26	0.18	-	-	1	60%	1
9VFC_LFA_E_511	15%	94%	0.162	0.855	0.25	0.19	-	-	0	70%	1
9VFC_LFA_H_510	15%	94%	0.155	0.866	0.25	0.19	-	-	0	60%	1
9VFC_LFA_A_509	15%	94%	0.157	0.879	0.26	0.18	-	-	2	55%	1
9VFC_LFA_G_409	15%	93%	0.155	0.84	0.26	0.2	-	-	0	70%	1
9VFC_LFA_G_406	14%	93%	0.157	0.873	0.25	0.22	-	-	0	55%	1
9VFC_LFA_A_512	14%	95%	0.15	0.907	0.29	0.13	-	-	0	35%	1
9VFC_LFA_B_512	14%	94%	0.162	0.854	0.24	0.21	-	-	0	65%	1
9VFC_LFA_G_410	13%	93%	0.188	0.811	0.25	0.21	-	-	2	100%	1
9VFC_LFA_C_514	13%	94%	0.16	0.855	0.25	0.2	-	-	4	60%	1
9VFC_LFA_F_514	13%	94%	0.162	0.855	0.26	0.19	-	-	2	60%	1
9VFC_LFA_E_516	13%	95%	0.142	0.878	0.28	0.13	-	-	0	35%	1
9VFC_LFA_G_402	12%	92%	0.18	0.858	0.25	0.25	-	-	0	70%	1
9VFC_LFA_D_402	12%	94%	0.154	0.859	0.26	0.18	-	-	0	50%	1
9VFC_LFA_F_506	12%	94%	0.162	0.86	0.26	0.18	-	-	2	55%	1
9VFC_LFA_F_513	12%	93%	0.179	0.841	0.24	0.22	-	-	0	75%	1
9VFC_LFA_C_502	12%	96%	0.156	0.884	0.29	0.12	-	-	0	40%	1
9VFC_LFA_A_511	12%	93%	0.161	0.832	0.25	0.21	-	-	1	65%	1
9VFC_LFA_A_501	12%	94%	0.128	0.822	0.27	0.17	-	-	0	45%	1
9VFC_LFA_A_502	11%	95%	0.149	0.867	0.29	0.13	-	-	0	40%	1
9VFC_LFA_F_502	11%	96%	0.141	0.853	0.29	0.11	-	-	0	40%	1
9VFC_LFA_B_513	11%	93%	0.162	0.84	0.25	0.21	-	-	1	60%	1
9VFC_LFA_B_515	11%	94%	0.16	0.86	0.26	0.18	-	-	1	50%	1
9VFC_LFA_H_503	11%	96%	0.153	0.877	0.29	0.12	-	-	0	35%	1
9VFC_LFA_C_509	11%	95%	0.196	0.807	0.25	0.18	-	-	1	95%	1
9VFC_LFA_B_510	10%	94%	0.167	0.836	0.26	0.18	-	-	0	60%	1
9VFC_LFA_F_504	10%	96%	0.164	0.887	0.28	0.12	-	-	0	35%	1
9VFC_LFA_A_506	10%	95%	0.176	0.856	0.27	0.16	-	-	0	55%	1
9VFC_LFA_C_507	9%	96%	0.172	0.893	0.28	0.12	-	-	0	35%	1
9VFC_LFA_A_504	9%	95%	0.189	0.85	0.27	0.15	-	-	0	65%	1
9VFC_LFA_E_504	9%	94%	0.173	0.856	0.26	0.18	-	-	0	50%	1
9VFC_LFA_G_401	9%	94%	0.186	0.878	0.27	0.17	-	-	0	50%	1
9VFC_LFA_F_510	9%	94%	0.168	0.835	0.25	0.19	-	-	3	55%	1
9VFC_LFA_H_506	9%	94%	0.168	0.828	0.25	0.19	-	-	0	55%	1
9VFC_LFA_F_507	9%	95%	0.178	0.833	0.26	0.16	-	-	1	60%	1
9VFC_LFA_E_507	8%	95%	0.17	0.84	0.27	0.15	-	-	0	50%	1
9VFC_LFA_F_517	8%	96%	0.17	0.859	0.29	0.12	-	-	0	40%	1
9VFC_LFA_D_405	8%	94%	0.217	0.797	0.26	0.19	-	-	3	100%	1
9VFC_LFA_F_511	8%	94%	0.19	0.868	0.25	0.19	-	-	2	50%	1
9VFC_LFA_A_505	8%	93%	0.173	0.825	0.26	0.2	-	-	1	55%	1
9VFC_LFA_H_508	8%	96%	0.179	0.88	0.29	0.11	-	-	0	35%	1
9VFC_LFA_C_504	8%	95%	0.158	0.844	0.29	0.13	-	-	0	35%	1
9VFC_LFA_A_507	7%	96%	0.16	0.843	0.3	0.1	-	-	0	35%	1
9VFC_LFA_G_404	7%	94%	0.18	0.84	0.27	0.18	-	-	1	50%	1
9VFC_LFA_F_503	7%	94%	0.174	0.841	0.28	0.16	-	-	0	45%	1
9VFC_LFA_H_505	7%	94%	0.164	0.775	0.26	0.18	-	-	0	65%	1
9VFC_LFA_D_415	7%	95%	0.207	0.823	0.25	0.18	-	-	3	75%	1
9VFC_LFA_D_403	7%	94%	0.189	0.827	0.25	0.19	-	-	0	60%	1
9VFC_LFA_E_512	7%	93%	0.199	0.808	0.25	0.21	-	-	0	75%	1
9VFC_LFA_A_516	7%	95%	0.177	0.781	0.25	0.18	-	-	1	70%	1
9VFC_LFA_C_510	7%	95%	0.149	0.816	0.28	0.13	-	-	0	35%	1
9VFC_LFA_E_503	7%	95%	0.189	0.847	0.27	0.15	-	-	1	50%	1
9VFC_LFA_B_507	6%	94%	0.176	0.818	0.26	0.19	-	-	1	50%	1
9VFC_LFA_G_405	6%	95%	0.183	0.849	0.29	0.13	-	-	0	40%	1
9VFC_LFA_H_504	6%	95%	0.174	0.819	0.27	0.15	-	-	0	45%	1
9VFC_LFA_E_515	6%	94%	0.196	0.829	0.26	0.18	-	-	1	55%	1
9VFC_LFA_A_513	6%	94%	0.187	0.812	0.26	0.18	-	-	0	55%	1
9VFC_LFA_D_408	6%	91%	0.155	0.828	0.29	0.24	-	-	0	25%	1
9VFC_LFA_D_410	6%	95%	0.17	0.806	0.28	0.13	-	-	0	45%	1
9VFC_LFA_H_502	5%	96%	0.183	0.845	0.29	0.11	-	-	0	35%	1
9VFC_LFA_D_414	5%	96%	0.204	0.832	0.28	0.12	-	-	0	55%	1
9VFC_LFA_A_503	5%	95%	0.17	0.762	0.26	0.17	-	-	0	60%	1
9VFC_LFA_G_407	5%	94%	0.185	0.811	0.25	0.19	-	-	0	50%	1
9VFC_LFA_F_512	5%	95%	0.165	0.824	0.28	0.15	-	-	0	30%	1
9VFC_LFA_E_501	5%	95%	0.201	0.86	0.28	0.13	-	-	0	40%	1
9VFC_LFA_E_514	5%	96%	0.184	0.839	0.29	0.11	-	-	0	35%	1
9VFC_LFA_D_407	5%	95%	0.173	0.808	0.28	0.14	-	-	0	40%	1
9VFC_LFA_A_515	5%	95%	0.167	0.82	0.29	0.14	-	-	0	30%	1
9VFC_LFA_F_508	4%	95%	0.187	0.809	0.26	0.17	-	-	0	45%	1
9VFC_LFA_C_508	4%	94%	0.199	0.826	0.26	0.19	-	-	3	45%	1
9VFC_LFA_D_413	4%	95%	0.186	0.792	0.26	0.16	-	-	0	50%	1
9VFC_LFA_D_406	4%	96%	0.204	0.815	0.27	0.13	-	-	0	50%	1
9VFC_LFA_H_507	4%	95%	0.19	0.821	0.3	0.12	-	-	0	35%	1
9VFC_LFA_C_506	4%	96%	0.189	0.812	0.29	0.12	-	-	0	35%	1
9VFC_LFA_G_418	4%	95%	0.189	0.774	0.27	0.16	-	-	0	50%	1
9VFC_LFA_H_513	4%	96%	0.218	0.846	0.29	0.12	-	-	0	40%	1
9VFC_LFA_G_415	3%	94%	0.203	0.783	0.26	0.18	-	-	0	55%	1
9VFC_LFA_B_502	3%	94%	0.189	0.759	0.26	0.19	-	-	0	55%	1
9VFC_LFA_E_510	3%	95%	0.166	0.779	0.29	0.14	-	-	0	30%	1
9VFC_LFA_D_404	3%	96%	0.199	0.811	0.28	0.11	-	-	0	40%	1
9VFC_LFA_F_509	3%	96%	0.195	0.811	0.29	0.12	-	-	0	35%	1
9VFC_LFA_D_409	3%	95%	0.222	0.828	0.28	0.15	-	-	0	45%	1
9VFC_LFA_G_417	3%	95%	0.194	0.8	0.29	0.14	-	-	0	30%	1
9VFC_LFA_E_506	3%	95%	0.177	0.757	0.27	0.15	-	-	0	35%	1
9VFC_LFA_G_416	3%	95%	0.22	0.781	0.26	0.16	-	-	0	55%	1
9VFC_LFA_H_512	3%	94%	0.218	0.797	0.27	0.17	-	-	0	45%	1
9VFC_LFA_F_515	2%	95%	0.181	0.75	0.29	0.13	-	-	0	35%	1
9VFC_LFA_H_511	2%	94%	0.194	0.735	0.27	0.17	-	-	0	50%	1
9VFC_LFA_C_512	1%	95%	0.215	0.737	0.28	0.14	-	-	1	40%	1
9VFC_LFA_C_513	1%	95%	0.231	0.739	0.28	0.15	-	-	0	45%	1
9VFC_LFA_E_508	1%	96%	0.235	0.765	0.29	0.11	-	-	0	35%	1
9VFC_LFA_C_511	1%	95%	0.224	0.71	0.27	0.15	-	-	1	50%	1
9VFC_LFA_H_509	1%	95%	0.205	0.714	0.28	0.14	-	-	0	30%	1
9VFC_LFA_E_509	1%	95%	0.251	0.695	0.27	0.14	-	-	0	45%	1
8ANQ_LFA_T_401	95%	100%	0.044	0.983	0.07	0.04	-	-	6	100%	1
7AKX_LFA_B_301	84%	100%	0.069	0.979	0.1	0.04	-	-	1	100%	1
7Z0E_LFA_P_319	74%	76%	0.071	0.939	0.12	0.71	-	-	4	100%	1
6EIG_LFA_A_1106	68%	77%	0.082	0.988	0.25	0.58	-	-	0	75%	1
6SU3_LFA_X_305	59%	99%	0.082	0.932	0.16	0.11	-	-	1	80%	1

RCSB PDB is hosted by

RCSB PDB is a member of

RCSB Partners
Nucleic Acid Knowledgebase

RCSB PDB Core Operations are funded by the U.S. National Science Foundation (DBI-2321666), the US Department of Energy (DE-SC0019749), and the National Cancer Institute, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, and National Institute of General Medical Sciences of the National Institutes of Health under grant R01GM157729. RCSB PDB uses resources of the National Energy Research Scientific Computing Center (NERSC), a Department of Energy User Facility.

9VFC | pdb_00009vfc

LFA: EICOSANE