9JF5 | pdb_00009jf5


EDO: 1,2-ETHANEDIOL

Help
Best-fitted instance in this entry
Other instances in this entry
Best-fitted instance in this entry
Best-fitted PDB instances with same target (top 5)
Best-fitted instance in this entry
Best-fitted PDB instances with different target (top 5)
IdentifierRanking for goodness of fit Ranking for geometry Real space R factor Real space correlation coefficient RMSZ-bond-length RMSZ-bond-angleOutliers of bond length Outliers of bond angle Atomic clashesStereochemical errorsModel completenessAverage occupancy
9JF5_EDO_C_504 96% 88% 0.041 0.9880.28 0.34 - -00100%1
9JF5_EDO_B_505 94% 91% 0.045 0.9830.25 0.27 - -00100%1
9JF5_EDO_D_502 93% 93% 0.047 0.9820.27 0.19 - -00100%1
9JF5_EDO_A_504 93% 94% 0.047 0.9820.25 0.2 - -00100%1
9JF5_EDO_B_504 88% 85% 0.058 0.9770.27 0.42 - -00100%1
9JF5_EDO_A_503 84% 86% 0.062 0.9640.28 0.39 - -00100%1
9JF5_EDO_D_503 82% 96% 0.075 0.9790.27 0.11 - -00100%1
9JF5_EDO_B_507 77% 94% 0.078 0.9620.27 0.17 - -00100%1
9JF5_EDO_B_508 76% 87% 0.079 0.960.24 0.4 - -00100%1
9JF5_EDO_C_511 72% 91% 0.089 0.9590.24 0.28 - -00100%1
9JF5_EDO_E_604 68% 81% 0.088 0.9410.25 0.51 - -00100%1
9JF5_EDO_A_523 68% 91% 0.09 0.9440.26 0.27 - -00100%1
9JF5_EDO_H_602 68% 85% 0.09 0.9430.23 0.46 - -00100%1
9JF5_EDO_G_602 67% 80% 0.099 0.9560.24 0.53 - -00100%1
9JF5_EDO_D_505 66% 91% 0.087 0.9290.25 0.28 - -00100%1
9JF5_EDO_C_506 64% 95% 0.095 0.9310.25 0.18 - -10100%1
9JF5_EDO_D_508 63% 95% 0.1 0.9390.3 0.13 - -00100%1
9JF5_EDO_C_508 63% 93% 0.103 0.9420.26 0.2 - -00100%1
9JF5_EDO_A_516 62% 74% 0.106 0.9440.22 0.66 - -00100%1
9JF5_EDO_C_507 62% 99% 0.104 0.9380.26 0.05 - -00100%1
9JF5_EDO_B_527 62% 73% 0.11 0.9470.22 0.69 - -00100%1
9JF5_EDO_A_509 60% 88% 0.111 0.9420.24 0.38 - -00100%1
9JF5_EDO_C_521 59% 90% 0.113 0.9390.28 0.29 - -10100%1
9JF5_EDO_D_533 58% 73% 0.11 0.9310.2 0.71 - -00100%1
9JF5_EDO_A_510 58% 90% 0.11 0.9310.2 0.34 - -00100%1
9JF5_EDO_C_524 58% 89% 0.108 0.9270.25 0.34 - -00100%1
9JF5_EDO_C_517 57% 88% 0.106 0.9190.24 0.38 - -00100%1
9JF5_EDO_A_508 57% 91% 0.114 0.930.24 0.29 - -00100%1
9JF5_EDO_B_540 56% 91% 0.109 0.920.07 0.43 - -20100%1
9JF5_EDO_C_514 54% 77% 0.116 0.9220.23 0.59 - -00100%1
9JF5_EDO_D_507 54% 92% 0.107 0.9050.27 0.22 - -00100%1
9JF5_EDO_B_515 52% 80% 0.117 0.9110.22 0.55 - -00100%1
9JF5_EDO_D_509 51% 86% 0.125 0.9210.26 0.4 - -00100%1
9JF5_EDO_A_528 50% 85% 0.126 0.920.2 0.49 - -10100%1
9JF5_EDO_A_515 50% 87% 0.12 0.9090.25 0.38 - -00100%1
9JF5_EDO_A_525 50% 91% 0.108 0.8860.25 0.29 - -10100%1
9JF5_EDO_D_529 48% 91% 0.134 0.9220.28 0.25 - -00100%1
9JF5_EDO_A_526 48% 77% 0.122 0.9010.26 0.56 - -00100%1
9JF5_EDO_C_513 47% 88% 0.149 0.9430.23 0.37 - -00100%1
9JF5_EDO_A_521 46% 91% 0.125 0.8990.27 0.27 - -00100%1
9JF5_EDO_C_509 46% 92% 0.118 0.8850.24 0.26 - -00100%1
9JF5_EDO_F_602 45% 86% 0.124 0.890.24 0.43 - -00100%1
9JF5_EDO_D_517 44% 85% 0.13 0.8980.23 0.46 - -10100%1
9JF5_EDO_B_528 44% 90% 0.133 0.9030.24 0.33 - -00100%1
9JF5_EDO_B_541 42% 91% 0.142 0.9050.14 0.39 - -00100%1
9JF5_EDO_C_529 41% 87% 0.125 0.8750.24 0.4 - -00100%1
9JF5_EDO_B_520 40% 88% 0.127 0.870.25 0.36 - -00100%1
9JF5_EDO_D_510 40% 75% 0.136 0.8840.22 0.64 - -00100%1
9JF5_EDO_B_519 39% 91% 0.134 0.8790.25 0.28 - -00100%1
9JF5_EDO_B_511 39% 92% 0.124 0.8620.26 0.25 - -00100%1
9JF5_EDO_A_514 39% 90% 0.132 0.8750.26 0.29 - -00100%1
9JF5_EDO_A_506 38% 97% 0.139 0.8820.25 0.11 - -00100%1
9JF5_EDO_C_532 38% 95% 0.137 0.8760.28 0.15 - -00100%1
9JF5_EDO_C_536 38% 76% 0.156 0.9080.23 0.6 - -00100%1
9JF5_EDO_B_533 37% 92% 0.167 0.9240.26 0.24 - -00100%1
9JF5_EDO_B_535 37% 96% 0.143 0.8820.27 0.13 - -00100%1
9JF5_EDO_E_602 37% 95% 0.131 0.8610.24 0.17 - -00100%1
9JF5_EDO_C_530 36% 90% 0.129 0.8550.25 0.3 - -00100%1
9JF5_EDO_D_534 36% 88% 0.14 0.8730.24 0.38 - -00100%1
9JF5_EDO_A_527 36% 84% 0.165 0.9150.23 0.47 - -00100%1
9JF5_EDO_D_504 35% 88% 0.15 0.8860.24 0.36 - -00100%1
9JF5_EDO_D_528 35% 84% 0.159 0.8980.24 0.46 - -00100%1
9JF5_EDO_D_526 34% 88% 0.134 0.8550.24 0.37 - -00100%1
9JF5_EDO_D_519 34% 90% 0.134 0.8550.24 0.33 - -00100%1
9JF5_EDO_A_517 34% 89% 0.144 0.8680.24 0.35 - -00100%1
9JF5_EDO_B_518 33% 87% 0.156 0.8850.24 0.39 - -00100%1
9JF5_EDO_B_536 33% 97% 0.16 0.8910.28 0.1 - -00100%1
9JF5_EDO_A_520 33% 88% 0.145 0.8650.27 0.35 - -00100%1
9JF5_EDO_B_521 32% 86% 0.134 0.8420.22 0.44 - -00100%1
9JF5_EDO_B_510 32% 90% 0.122 0.820.26 0.31 - -00100%1
9JF5_EDO_C_534 31% 91% 0.146 0.8590.26 0.26 - -00100%1
9JF5_EDO_D_521 31% 84% 0.152 0.8680.21 0.49 - -00100%1
9JF5_EDO_B_506 31% 79% 0.164 0.8880.21 0.58 - -10100%1
9JF5_EDO_A_532 30% 89% 0.135 0.8360.25 0.34 - -00100%1
9JF5_EDO_D_525 30% 91% 0.145 0.8490.24 0.29 - -10100%1
9JF5_EDO_B_530 29% 90% 0.156 0.8640.22 0.35 - -10100%1
9JF5_EDO_A_524 29% 87% 0.149 0.8520.25 0.39 - -00100%1
9JF5_EDO_C_528 29% 87% 0.152 0.8550.23 0.41 - -00100%1
9JF5_EDO_D_515 29% 93% 0.129 0.8160.26 0.2 - -10100%1
9JF5_EDO_D_522 29% 88% 0.154 0.8580.26 0.35 - -00100%1
9JF5_EDO_C_522 28% 87% 0.174 0.8910.27 0.36 - -00100%1
9JF5_EDO_A_507 28% 91% 0.176 0.8930.3 0.24 - -00100%1
9JF5_EDO_A_519 28% 92% 0.162 0.8670.31 0.2 - -20100%1
9JF5_EDO_B_532 28% 87% 0.193 0.9190.28 0.37 - -00100%1
9JF5_EDO_D_506 28% 93% 0.17 0.8790.26 0.22 - -10100%1
9JF5_EDO_D_523 27% 87% 0.147 0.840.26 0.38 - -00100%1
9JF5_EDO_B_522 27% 91% 0.137 0.8230.27 0.27 - -00100%1
9JF5_EDO_D_520 27% 92% 0.149 0.8420.25 0.24 - -00100%1
9JF5_EDO_D_524 27% 84% 0.148 0.840.28 0.43 - -10100%1
9JF5_EDO_B_514 25% 93% 0.166 0.860.27 0.21 - -00100%1
9JF5_EDO_A_522 25% 91% 0.168 0.8620.28 0.25 - -10100%1
9JF5_EDO_G_603 24% 91% 0.178 0.8730.23 0.29 - -10100%1
9JF5_EDO_A_513 24% 84% 0.172 0.8620.25 0.45 - -10100%1
9JF5_EDO_B_529 24% 81% 0.163 0.8440.24 0.52 - -00100%1
9JF5_EDO_H_603 23% 86% 0.147 0.8160.25 0.42 - -10100%1
9JF5_EDO_C_527 23% 90% 0.15 0.8210.24 0.31 - -00100%1
9JF5_EDO_B_516 22% 92% 0.182 0.8680.25 0.26 - -00100%1
9JF5_EDO_A_530 22% 92% 0.202 0.9010.24 0.26 - -10100%1
9JF5_EDO_D_527 22% 91% 0.147 0.8060.27 0.27 - -00100%1
9JF5_EDO_B_509 22% 88% 0.161 0.8290.31 0.3 - -20100%1
9JF5_EDO_C_512 21% 77% 0.182 0.8610.25 0.58 - -00100%1
9JF5_EDO_B_526 19% 88% 0.173 0.8330.22 0.38 - -10100%1
9JF5_EDO_C_515 19% 95% 0.164 0.8170.26 0.17 - -00100%1
9JF5_EDO_C_519 19% 90% 0.184 0.850.23 0.32 - -10100%1
9JF5_EDO_C_518 18% 93% 0.157 0.7980.26 0.21 - -00100%1
9JF5_EDO_D_514 18% 94% 0.161 0.8030.24 0.2 - -00100%1
9JF5_EDO_A_535 18% 84% 0.183 0.8390.24 0.47 - -00100%1
9JF5_EDO_A_534 18% 95% 0.169 0.8150.26 0.15 - -00100%1
9JF5_EDO_D_532 18% 85% 0.188 0.8460.28 0.4 - -00100%1
9JF5_EDO_B_525 18% 90% 0.155 0.790.27 0.28 - -00100%1
9JF5_EDO_C_516 17% 92% 0.163 0.8010.24 0.26 - -00100%1
9JF5_EDO_C_525 17% 89% 0.169 0.8090.25 0.33 - -00100%1
9JF5_EDO_E_603 17% 93% 0.152 0.780.26 0.2 - -00100%1
9JF5_EDO_D_511 16% 84% 0.193 0.8460.23 0.47 - -00100%1
9JF5_EDO_C_526 16% 94% 0.169 0.8020.26 0.19 - -00100%1
9JF5_EDO_D_516 16% 93% 0.216 0.8810.29 0.19 - -00100%1
9JF5_EDO_B_534 15% 97% 0.213 0.8710.25 0.1 - -20100%1
9JF5_EDO_C_520 15% 94% 0.174 0.8030.27 0.18 - -00100%1
9JF5_EDO_D_530 15% 89% 0.204 0.8510.26 0.34 - -00100%1
9JF5_EDO_C_537 15% 83% 0.197 0.8390.22 0.5 - -00100%1
9JF5_EDO_A_512 15% 88% 0.174 0.80.22 0.4 - -10100%1
9JF5_EDO_A_505 15% 94% 0.199 0.8410.26 0.19 - -00100%1
9JF5_EDO_D_518 13% 91% 0.161 0.7640.26 0.28 - -00100%1
9JF5_EDO_B_537 13% 89% 0.221 0.8640.25 0.35 - -00100%1
9JF5_EDO_B_512 12% 91% 0.218 0.8520.24 0.28 - -20100%1
9JF5_EDO_A_518 12% 91% 0.193 0.8090.25 0.28 - -00100%1
9JF5_EDO_C_523 12% 91% 0.178 0.7810.26 0.28 - -00100%1
9JF5_EDO_C_531 11% 89% 0.199 0.8080.27 0.31 - -10100%1
9JF5_EDO_B_531 11% 98% 0.19 0.7920.26 0.06 - -20100%1
9JF5_EDO_A_533 11% 89% 0.21 0.8220.23 0.35 - -00100%1
9JF5_EDO_C_533 10% 80% 0.226 0.8410.26 0.52 - -00100%1
9JF5_EDO_D_513 10% 96% 0.226 0.8380.25 0.14 - -00100%1
9JF5_EDO_D_512 10% 90% 0.16 0.7260.26 0.3 - -00100%1
9JF5_EDO_B_524 9% 86% 0.208 0.7990.25 0.41 - -00100%1
9JF5_EDO_B_513 9% 94% 0.216 0.8060.26 0.19 - -00100%1
9JF5_EDO_A_536 9% 55% 0.165 0.7190.52 1.01 - -30100%1
9JF5_EDO_B_517 9% 87% 0.183 0.7470.27 0.37 - -00100%1
9JF5_EDO_A_529 7% 89% 0.194 0.7380.26 0.34 - -00100%1
9JF5_EDO_A_531 6% 90% 0.179 0.7080.24 0.33 - -00100%1
9JF5_EDO_C_505 6% 88% 0.254 0.8270.24 0.36 - -00100%1
9JF5_EDO_B_538 6% 89% 0.249 0.8180.23 0.36 - -00100%1
9JF5_EDO_B_539 5% 58% 0.205 0.7250.76 0.68 - -30100%1
9JF5_EDO_B_523 4% 91% 0.24 0.7690.22 0.29 - -20100%1
9JF5_EDO_C_535 4% 93% 0.217 0.7160.28 0.18 - -10100%1
9JF5_EDO_A_511 4% 89% 0.18 0.6530.26 0.32 - -00100%1
9JF5_EDO_D_531 4% 96% 0.215 0.7090.25 0.14 - -10100%1
9JF5_EDO_C_510 3% 86% 0.244 0.7430.25 0.41 - -20100%1
9JF5_EDO_D_535 2% 67% 0.267 0.70.37 0.71 - -30100%1
9JER_EDO_B_507 94% 92% 0.045 0.980.25 0.26 - -00100%1
9JFN_EDO_C_503 82% 92% 0.067 0.9640.32 0.17 - -00100%1
4Q6J_EDO_A_302 100% 80% 0.013 0.9990.37 0.42 - -00100%1
5MZ2_EDO_B_903 100% 84% 0.012 0.9980.49 0.24 - -00100%1
5IU0_EDO_A_505 100% 87% 0.015 0.9980.44 0.22 - -00100%1
5VRB_EDO_A_701 100% 68% 0.015 0.9980.39 0.66 - -00100%1
3QNB_EDO_B_1 100% 63% 0.016 0.9980.45 0.76 - -20100%1