4CI2 | pdb_00004ci2

Structure of the DDB1-CRBN E3 ubiquitin ligase bound to lenalidomide

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RCSB PDB Mol* Viewer 2.11.2 [1/27/2025, 4:56:27 PM]
Electron Density
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Sequence of
     ​M​​H​​H​​H​​H​​H​​H​​R​​R​​L​     ​V​​P​​R​​G​​S​​G​​G​​R​​M​​S​3    ​Y​​N​​Y​​V​​V​​T​​A​​Q​​K​​P​13   ​T​​A​​V​​N​​G​​C​​V​​T​​G​​H​23   ​F​​T​​S​​A​​E​​D​​L​​N​​L​​L​33   ​I​​A​​K​​N​​T​​R​​L​​E​​I​​Y​43   ​V​​V​​T​​A​​E​​G​​L​​R​​P​​V​53   ​K​​E​​V​​G​​M​​Y​​G​​K​​I​​A​63   ​V​​M​​E​​L​​F​​R​​P​​K​​G​​E​73   ​S​​K​​D​​L​​L​​F​​I​​L​​T​​A​83   ​K​​Y​​N​​A​​C​​I​​L​​E​​Y​​K​93   ​Q​​S​​G​​E​​S​​I​​D​​I​​I​​T​103  ​R​​A​​H​​G​​N​​V​​Q​​D​​R​​I​113  ​G​​R​​P​​S​​E​​T​​G​​I​​I​​G​123  ​I​​I​​D​​P​​E​​C​​R​​M​​I​​G​133  ​L​​R​​L​​Y​​D​​G​​L​​F​​K​​V​143  ​I​​P​​L​​D​​R​​D​​N​​K​​E​​L​153  ​K​​A​​F​​N​​I​​R​​L​​E​​E​​L​163  ​H​​V​​I​​D​​V​​K​​F​​L​​Y​​G​173  ​C​​Q​​A​​P​​T​​I​​C​​F​​V​​Y​183  ​Q​​D​​P​​Q​​G​​R​​H​​V​​K​​T​193  ​Y​​E​​V​​S​​L​​R​​E​​K​​E​​F​203  ​N​​K​​G​​P​​W​​K​​Q​​E​​N​​V​213  ​E​​A​​E​​A​​S​​M​​V​​I​​A​​V​223  ​P​​E​​P​​F​​G​​G​​A​​I​​I​​I​233  ​G​​Q​​E​​S​​I​​T​​Y​​H​​N​​G​243  ​D​​K​​Y​​L​​A​​I​​A​​P​​P​​I​253  ​I​​K​​Q​​S​​T​​I​​V​​C​​H​​N​263  ​R​​V​​D​​P​​N​​G​​S​​R​​Y​​L​273  ​L​​G​​D​​M​​E​​G​​R​​L​​F​​M​283  ​L​​L​​L​​E​​K​​E​​E​​Q​​M​​D​     ​G​​T​​V​​T​​L​​K​​D​​L​​R​​V​303  ​E​​L​​L​​G​​E​​T​​S​​I​​A​​E​313  ​C​​L​​T​​Y​​L​​D​​N​​G​​V​​V​323  ​F​​V​​G​​S​​R​​L​​G​​D​​S​​Q​333  ​L​​V​​K​​L​​N​​V​​D​​S​​N​​E​343  ​Q​​G​​S​​Y​​V​​V​​A​​M​​E​​T​353  ​F​​T​​N​​L​​G​​P​​I​​V​​D​​M​363  ​C​​V​​V​​D​​L​​E​​R​​Q​​G​​Q​373  ​G​​Q​​L​​V​​T​​C​​S​​G​​A​​F​383  ​K​​E​​G​​S​​L​​R​​I​​I​​R​​N​393  ​G​​I​​G​​I​​H​​E​​H​​A​​S​​I​403  ​D​​L​​P​​G​​I​​K​​G​​L​​W​​P​413  ​L​​R​​S​​D​​P​​N​​R​​E​​T​​D​423  ​D​​T​​L​​V​​L​​S​​F​​V​​G​​Q​433  ​T​​R​​V​​L​​M​​L​​N​​G​​E​​E​443  ​V​​E​​E​​T​​E​​L​​M​​G​​F​​V​453  ​D​​D​​Q​​Q​​T​​F​​F​​C​​G​​N​463  ​V​​A​​H​​Q​​Q​​L​​I​​Q​​I​​T​473  ​S​​A​​S​​V​​R​​L​​V​​S​​Q​​E​483  ​P​​K​​A​​L​​V​​S​​E​​W​​K​​E​493  ​P​​Q​​A​​K​​N​​I​​S​​V​​A​​S​503  ​C​​N​​S​​S​​Q​​V​​V​​V​​A​​V​513  ​G​​R​​A​​L​​Y​​Y​​L​​Q​​I​​H​523  ​P​​Q​​E​​L​​R​​Q​​I​​S​​H​​T​533  ​E​​M​​E​​H​​E​​V​​A​​C​​L​​D​543  ​I​​T​​P​​L​​G​​D​​S​​N​​G​​L​553  ​S​​P​​L​​C​​A​​I​​G​​L​​W​​T​563  ​D​​I​​S​​A​​R​​I​​L​​K​​L​​P​573  ​S​​F​​E​​L​​L​​H​​K​​E​​M​​L​583  ​G​​G​​E​​I​​I​​P​​R​​S​​I​​L​593  ​M​​T​​T​​F​​E​​S​​S​​H​​Y​​L​603  ​L​​C​​A​​L​​G​​D​​G​​A​​L​​F​613  ​Y​​F​​G​​L​​N​​I​​E​​T​​G​​L​623  ​L​​S​​D​​R​​K​​K​​V​​T​​L​​G​633  ​T​​Q​​P​​T​​V​​L​​R​​T​​F​​R​643  ​S​​L​​S​​T​​T​​N​​V​​F​​A​​C​653  ​S​​D​​R​​P​​T​​V​​I​​Y​​S​​S​663  ​N​​H​​K​​L​​V​​F​​S​​N​​V​​N​673  ​L​​K​​E​​V​​N​​Y​​M​​C​​P​​L​683  ​N​​S​​D​​G​​Y​​P​​D​​S​​L​​A​693  ​L​​A​​N​​N​​S​​T​​L​​T​​I​​G​703  ​T​​I​​D​​E​​I​​Q​​K​​L​​H​​I​713  ​R​​T​​V​​P​​L​​Y​​E​​S​​P​​R​723  ​K​​I​​C​​Y​​Q​​E​​V​​S​​Q​​C​733  ​F​​G​​V​​L​​S​​S​​R​​I​​E​​V​743  ​Q​​D​​T​​S​​G​​G​​T​​T​​A​​L​753  ​R​​P​​S​​A​​S​​T​​Q​​A​​L​​S​763  ​S​​S​​V​​S​​S​​S​​K​​L​​F​​S​     ​S​​S​​T​​A​​P​​H​​E​​T​​S​​F​     ​G​​E​​E​​V​​E​​V​​H​​N​​L​​L​793  ​I​​I​​D​​Q​​H​​T​​F​​E​​V​​L​803  ​H​​A​​H​​Q​​F​​L​​Q​​N​​E​​Y​813  ​A​​L​​S​​L​​V​​S​​C​​K​​L​​G​823  ​K​​D​​P​​N​​T​​Y​​F​​I​​V​​G​833  ​T​​A​​M​​V​​Y​​P​​E​​E​​A​​E​843  ​P​​K​​Q​​G​​R​​I​​V​​V​​F​​Q​853  ​Y​​S​​D​​G​​K​​L​​Q​​T​​V​​A​863  ​E​​K​​E​​V​​K​​G​​A​​V​​Y​​S​873  ​M​​V​​E​​F​​N​​G​​K​​L​​L​​A​883  ​S​​I​​N​​S​​T​​V​​R​​L​​Y​​E​893  ​W​​T​​T​​E​​K​​E​​L​​R​​T​​E​903  ​C​​N​​H​​Y​​N​​N​​I​​M​​A​​L​913  ​Y​​L​​K​​T​​K​​G​​D​​F​​I​​L​923  ​V​​G​​D​​L​​M​​R​​S​​V​​L​​L​933  ​L​​A​​Y​​K​​P​​M​​E​​G​​N​​F​943  ​E​​E​​I​​A​​R​​D​​F​​N​​P​​N​953  ​W​​M​​S​​A​​V​​E​​I​​L​​D​​D​963  ​D​​N​​F​​L​​G​​A​​E​​N​​A​​F​973  ​N​​L​​F​​V​​C​​Q​​K​​D​​S​​A​     ​A​​T​​T​​D​​E​​E​​R​​Q​​H​​L​993  ​Q​​E​​V​​G​​L​​F​​H​​L​​G​​E​1003 ​F​​V​​N​​V​​F​​C​​H​​G​​S​​L​1013 ​V​​M​​Q​​N​​L​​G​​E​​T​​S​​T​1023 ​P​​T​​Q​​G​​S​​V​​L​​F​​G​​T​1033 ​V​​N​​G​​M​​I​​G​​L​​V​​T​​S​1043 ​L​​S​​E​​S​​W​​Y​​N​​L​​L​​L​1053 ​D​​M​​Q​​N​​R​​L​​N​​K​​V​​I​1063 ​K​​S​​V​​G​​K​​I​​E​​H​​S​​F​1073 ​W​​R​​S​​F​​H​​T​​E​​R​​K​​T​1083 ​E​​P​​A​​T​​G​​F​​I​​D​​G​​D​1093 ​L​​I​​E​​S​​F​​L​​D​​I​​S​​R​1103 ​P​​K​​M​​Q​​E​​V​​V​​A​​N​​L​1113 ​Q​​Y​​D​​D​​G​​S​​G​​M​​K​​R​1123 ​E​​A​​T​​A​​D​​D​​L​​I​​K​​V​1133 ​V​​E​​E​​L​​T​​R​​I​​H​
Type
Asm Id
Dynamic Bonds

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Citation:

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